而到了王朝的中后期，由于国力下降，政治腐败，朝廷原有的军队己经腐化，而且朝廷的执行力也大大下降，无力再重新组军，就出现了个人能力比较强的将才自已组军的行为。其中又是以戚家军组军方式最好，也为后世的经代所推崇，不过在戚家军之间，南宋的岳家军其实也是这种模式，还包括明末的辽东军、清末的湘军、淮军都是釆用这种方式组军。

但这种组军的方式,是以同乡亲情为纽带，以对主将的个人忠诚为保障，并且带有很强的个人色彩，军队的实力大半取决于主将的个人能力，在短期内确定可以形成相当的战斗力，但不能维持长久，另外也容易成为某一人的私军。像清末的湘军、淮军，刚成军时确实战斗力不错，但十几年后就跨得十分历害。包括岳家军、戚家军也是一样，在岳飞、戚继光死后，军队的战斗力也在下降。

商毅从山东起事时，其实也是釆用的这种模式，包括在很长一段时间，军队的名字都被叫做商家军。但他毕竟是来自未来的人，当然知道这种组军模式的优劣，因此在占领浙江之后，就立刻开办军校，系统的培养军队骨干，实际是采用近代国家建军方式。当然在军校中也会重点强调对商毅的忠心。

尽管不是每一名士兵都是从军校毕业出来，但绝大多数的军官都经历过了中短期的军校培训，因此士兵军官的自身素质不仅可以得保障，加强了他们对商毅的忠诚度，也减少了对各军主将的心理依附力。

另外除了山东战区之外，士兵的钱粮军饷全部都是由**部直接供应，并派人下发到各军中，这样不仅降低了吃空饷，苛扣军饷的事情发生，而且也断绝了各军的主将插手军饷发放的事务，没有财政权，自然也就无法派脫受**部控制。当然在战事紧息的时候可以由各军主将暂时代理，一但战事结束，这项权利就会被**部马上收回。军区不插有地方财政.

还有一点，中华军是一支以火器为主的部队，枪炮火药的生产也都被牢牢控制在**部的手里，这样一来，各地的军队也就无法摆脫对**部的控制，也就无从独立。

当然只有山东军区是一个例外，在商毅占领浙江之后，山东地区实际是由周少桓在管理，周少桓不仅是商毅十分看重培养的年轻将领，同时也是周氏一系的重要人物，山东地区的其他将领，如唐镇、童大勇、蒋义渠、鲍铜钢等人，也都是山东系的主要人物。由于商毅鞭长莫及，因此山东地区一直都享有很大的自治权。

经过近四年的发展，现在的山东地区管辖的地方约十万平方公里的土地，拥有三百万左右的人口。已经在山东地区建立了军校、兵工厂、服装厂、车辆厂等一糸列相关工厂，基本能做到自给自足。周少桓等人也是功不可没。当然这也和商毅的充份信任和放权分不开。

不过商毅也从来就没有放松过对山东军区的控制，当然这种控制并非是安插什么督军，而是靠完善制度和长期坚持严格管理。

首先是商毅在山东安排孟宏恭处理民政、行政事务；孟宏恭并不属于周家的派糸，尽管他仍然要听命于山东军区，但至少可以让军区不能直接插手民政工作。其次是加强对山东的财政管理，每月、毎季、毎年的财政报表都必须准时送到**部来，好让商毅清楚，山东军区的财政状况和毎一笔开支的用途，也让山东军区的各级官员们不能轻易藏私舞弊。

而在山东军校也被商毅定位于凤凰军事学院山东分院，教官师资主要都是由浙江这边派遣过去，由于山东战区的战事并不多，因此山东分院还定期派遣学员到杭州来学习，从军事教育这一环就开始加强对山东军队的控制。

另外山东兵工厂只能生产一般的火枪火炮，手榴弹等武器，重点的雷汞技术、线膛枪、重型火炮等高尖武器，依然控制在杭州兵工厂里。

最后还有一点，周少桓的父亲周世奇和兄长周少卿这时全部都在江南任职，虽然都是位高权重，也很受商毅的信任，但从另一角度看，说他们是商毅留在南方的人质，也不算错。

因此综合这么多因素来看，在南京政府内部，最后可能发展成为独立势力的山东军区，实际独立的可能性也并不大。